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虎眼万年青对诱发肝癌病变基因的表达水平影响研究-口腔医疗器械

时间:2014-04-24 14:46来源:作者:点击:
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  1  材料
  1.1   药物提取
  取植物虎眼万年青,在自然条件下干燥,粉碎成粉。加入95%的乙醇浸泡24 h,纱布、滤纸过滤后,收集滤液,滤渣继续加入乙醇浸泡,同上方法循环 3次,收集滤液,将3次所得滤液合并。滤液经减压浓缩为原来体积的1/5,再用1/3体积的石油醚萃取脱脂,保留水相,再次减压蒸馏后,加水稀释上AB-8柱吸附,反复吸附3次,6~8倍柱体积水洗掉糖后用5倍柱体积95%乙醇洗脱皂苷。所得皂苷洗脱液,经D-280柱脱色后,减压浓缩后蒸干,即为虎眼万年青总皂苷。
  1.2  实验动物及设计
  雄性Wistar清洁级大鼠30只,体质量130~150 g,购自延边大学医学部实验动物中心。动物适应3 d后开始实验。正常组:整个实验过程中均饮用灭菌自来水及基础饲料,并于18周末宰杀6只。模型组:每日给予基础饲料同时,用灭菌自来水配制浓度为95 μg/ml的二乙基亚硝胺(DEN)溶液(美国Sigma公司,避光保存,新鲜配制),供大鼠自由饮用,每天更换1次。连续饮用4周后,改饮一般的灭菌自来水4周,再继续饮含95 μg/ml的DEN溶液。并分别于饲养第14周末、18周末分别宰杀各6只。肝硬化预防组:于实验开始在肝癌模型建立的同时, 根据预实验小鼠虎眼万年青总皂苷的LD50为3.2g/kg, 以接近于LD50之1/30的剂量,即相当于100mg/kg的给药浓度,以蒸馏水制成所需浓度的混悬液,每日灌胃并于14周末宰杀6只。肝癌治疗组:第14周后从模型组中随机选出6只,按模型组饲养同时给予虎眼万年青总皂苷100mg/kg,并于第18周末宰杀。
  1.3  取材及处理
  各组大鼠宰杀前禁食12h,称体质量,乙醚麻醉后, 解剖腹腔,取肝组织,出现癌灶者取肉眼癌结节及距癌灶边缘0.5~1cm癌旁组织约50~100mg样品,生理盐水冲洗,液氮快速冷冻,并置-70℃冰箱,待统一检测。
  1.4  试剂及器材
  TRIZOL试剂、无RNA酶的水、无RNA酶的糖原(Invitrogen life technologies);氯仿、异丙醇、100%乙醇、乙酸钠、甲醛(上海化学试剂有限公司);Tris-HCl、EDTA 、MOPS、溴化乙锭、2.5 mM dNTP混合液、100 bp DNA Ladder;RNA酶抑制剂;MMLV反转录酶;5xRT缓冲液。DK-8D型电热恒温水槽;Gene Amp PCR System 9700(Applied Biosystems);FeroTec Gradien PCR基因扩增仪;DYY-8型稳压稳流电泳;H6-1微型电泳槽;ABI 7700 Realtime PCR仪(ABI);引物设计软件:Primer 5.0。
  2 方法
  2.1  样品的RNA抽提
  ①每50~100 mg组织样品,加入1 ml的TRIZOL试剂,用电动匀浆器进行匀浆。②匀浆后样品于15~30℃孵育5 min。每1 ml的TRIZOL试剂匀浆的样品中加入0.2 ml的氯仿,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15 s后,15到30℃孵育2~3 min。4℃下12 000 r·min-1离心15 min。③将水相转移到新离心管中。水相与异丙醇混合以沉淀其中的RNA,加入异丙醇的量为每个样品匀浆时加入1 ml TRIZOL试剂的此时加0.5 ml的异丙醇。混匀后15到30°C孵育10 min后,于4℃12 000 r·min-1离心10 min。④移去上清液,每毫升TRIZOL试剂匀浆的样品中加入至少1 ml的75%乙醇,清洗RNA沉淀。振荡后,4℃ 7 500 r·min-1离心5 min。⑤去除乙醇溶液,空气中干燥RNA沉淀5~10 min,先加入无RNA酶的水用枪反复吹打几次,然后55到60℃孵育10 min。获得的RNA溶液保存于-70℃。
  2.2   使用样品的RNA进行cDNA合成
  2.2.1  配制退火混合物RNA 2 μg,0.5 μg/μl Oligo(dT)18 1μl,加无RNA酶的H2O至总体积 10 μl混合液在70℃水浴3 min,降到37℃放置10 min。
  2.2.2  RT反应液(5xRT缓冲液4μl,2.5mmol/L dNTP混合液4μl,RNA酶抑制剂1 μl,MMLV反转录酶1 μl,混合后37℃恒温1 min)。
  2.2.3  加10 μl的RT反应液到10 μl退火混合物中,37℃水浴60 min,加热到95℃维持5 min。得RT终溶液即cDNA溶液,置冰浴待用。
  2.3  合成的cDNA用于实时定量PCR
  2.3.1   制备用于绘制标准曲线的梯度稀释DNA模板
  针对每一需要测量的基因和管家基因,选择一确定表达该基因的cDNA模板进行PCR反应:dNTP(2.5 mmol/L each)(2.5 μl);10 × PCR缓冲液(2.5 μl);MgCl2 溶液(1.5 μl);Taq聚合酶(1U);10 μmol的PCR特异引物F(1 μl);10 μmol的PCR特异引物R(1 μl);cDNA(1 μl);加水至总体积为25 μl。轻弹管底将溶液混合,40个PCR循环(94℃,20 s;退火温度,20 s;72℃,30 s);72℃延伸5 min。
  将PCR产物进行10倍梯度稀释:设定standard1的浓度为106,standard 2的浓度为105 ,standard 3的浓度为104,standard 4的浓度为103,standard 5的浓度为102,standard 6的浓度为10,standard 7的浓度为1。见图1。
  2.3.2  进行Realtime PCR反应
  几个梯度稀释的DNA模板以及所有cDNA样品分别配置Realtime PCR反应体系。体系配置如下:dNTP(2.5mM each)(2.5μl);10x PCR缓冲液(2.5 μl)MgCl2 溶液(1.5 μl);Taq聚合酶(1units);Sybergreen(终浓度0.25×);50X  Rox(0.5 μl);10 μmol/L的PCR特异引物F(1μl);10 μmol/L的PCR特异引物R(1 μl);cDNA or DNA(1 μl);加水至总体积为25 μl。轻弹管底将溶液混合,5000 r/min短暂离心。
  3  结果
  各样品的目的基因和管家基因分别进行Realtime PCR反应。根据绘制的梯度稀释DNA标准曲线,各样品目的基因和管家基因的浓度结果直接由机器生成。每个样品的目的基因浓度除以其管家基因的浓度,即为此样品此基因的校正后的相对含量。实时定量PCR时各样品加样量均为1 μl,然而由于受RNA浓度定量误差和RNA逆转录效率误差等的影响,每个样品的1 μl体积的cDNA其含量并不完全相同,为校正此差异,使用管家基因beta-actin作为内参,以样品待测基因得值除以此样品内参值,最终得到的比值为样品的待测基因相对含量。
      
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